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Face à la propagation rapide des variants préoccupants du SARS-CoV-2, notamment les lignées B.1.1.7 (Alpha) et P.1 (Gamma), caractérisées par des mutations dans le domaine de liaison au récepteur (RBD) de la protéine Spike, il est crucial d’identifier rapidement des agents thérapeutiques efficaces.
Les mutations présentes dans ces variants augmentent leur affinité pour l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2), facilitant ainsi l’entrée virale dans les cellules hôtes.
L’étude vise à évaluer, par des méthodes de modélisation moléculaire, le potentiel d’inhibiteurs parmi les composés imidazoles et benzimidazoles (fenbendazole), des agents antiparasitaires bien établis, pour interférer avec la liaison de la protéine Spike des variants Alpha et Gamma à l’ACE2.
Une sélection de 15 composés imidazoles et benzimidazoles a été soumise à des analyses de docking moléculaire ciblant les structures cristallines des protéines Spike des variants Alpha (PDB ID: 7NEH) et Gamma (PDB ID: 7NXC). Les scores de liaison (glide scores) et les énergies libres de liaison ont été calculés pour évaluer l’affinité des composés pour les sites actifs des protéines virales.
Cette étude in silico suggère que certains agents antiparasitaires, notamment le flubendazole ou fenbendazole et le mébendazole, pourraient être repositionnés comme inhibiteurs potentiels de l’entrée du SARS-CoV-2, en particulier pour les variants Alpha et Gamma. Des études expérimentales complémentaires sont nécessaires pour valider ces résultats et évaluer leur pertinence clinique.